Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARHGEF28Q8N1W1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ARHGEF28Q8N1W1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ARHGEF28Q8N1W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF28Q8N1W1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms