Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z5

Sf3a1, Splicing factor 3A subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a1Q8K4Z5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sf3a1Q8K4Z5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3a1Q8K4Z5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3a1Q8K4Z5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3a1Q8K4Z5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms