Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw1Q8K4P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Hecw1Q8K4P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hecw1Q8K4P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hecw1Q8K4P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms