Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cdk5rap2Q8K389 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cdk5rap2Q8K389 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cdk5rap2Q8K389 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cdk5rap2Q8K389 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cdk5rap2Q8K389 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms