Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash3Q8K352 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash3Q8K352 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sash3Q8K352 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sash3Q8K352 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sash3Q8K352 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sash3Q8K352 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sash3Q8K352 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash3Q8K352 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sash3Q8K352 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sash3Q8K352 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.1 ms