Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arfip2Q8K221 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip2Q8K221 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfip2Q8K221 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arfip2Q8K221 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms