Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FgbQ8K0E8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FgbQ8K0E8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FgbQ8K0E8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms