Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pkn3Q8K045 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkn3Q8K045 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkn3Q8K045 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkn3Q8K045 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms