Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC50Q8IVM0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC50Q8IVM0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC50Q8IVM0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms