Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
P3H3Q8IVL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
P3H3Q8IVL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
P3H3Q8IVL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
P3H3Q8IVL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
P3H3Q8IVL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
P3H3Q8IVL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
P3H3Q8IVL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
P3H3Q8IVL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms