Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-Q4Q8HWB2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-Q4Q8HWB2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2-Q4Q8HWB2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2-Q4Q8HWB2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2-Q4Q8HWB2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.5 ms