Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syne4Q8CII8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syne4Q8CII8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Syne4Q8CII8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Syne4Q8CII8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syne4Q8CII8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms