Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmnQ8C5W0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmnQ8C5W0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ClmnQ8C5W0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ClmnQ8C5W0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ClmnQ8C5W0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms