Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc44a2Q8BY89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a2Q8BY89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc44a2Q8BY89 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc44a2Q8BY89 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms