Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NkrfQ8BY02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NkrfQ8BY02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NkrfQ8BY02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NkrfQ8BY02 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NkrfQ8BY02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NkrfQ8BY02 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NkrfQ8BY02 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NkrfQ8BY02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NkrfQ8BY02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NkrfQ8BY02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms