Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc169Q8BXX9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc169Q8BXX9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc169Q8BXX9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms