Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdsp2Q8BX07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctdsp2Q8BX07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdsp2Q8BX07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdsp2Q8BX07 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms