Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcaf1Q8BNE1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcaf1Q8BNE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcaf1Q8BNE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
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