Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GopcQ8BH60 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GopcQ8BH60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GopcQ8BH60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms