Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Npas4Q8BGD7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npas4Q8BGD7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npas4Q8BGD7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npas4Q8BGD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npas4Q8BGD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms