Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREML1Q86YW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREML1Q86YW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREML1Q86YW5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms