Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMS1Q86UR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMS1Q86UR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMS1Q86UR5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMS1Q86UR5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMS1Q86UR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RIMS1Q86UR5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms