Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srgap3Q812A2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srgap3Q812A2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Srgap3Q812A2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Srgap3Q812A2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Srgap3Q812A2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms