Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf38bQ80SY5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf38bQ80SY5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf38bQ80SY5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf38bQ80SY5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf38bQ80SY5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms