Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBBP6Q7Z6E9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBBP6Q7Z6E9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RBBP6Q7Z6E9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms