Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg1cQ7TSF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsg1cQ7TSF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms