Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms