Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LnpkQ7TQ95 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LnpkQ7TQ95 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LnpkQ7TQ95 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms