Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Robo2Q7TPD3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Robo2Q7TPD3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Robo2Q7TPD3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Robo2Q7TPD3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Robo2Q7TPD3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Robo2Q7TPD3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Robo2Q7TPD3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Robo2Q7TPD3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Robo2Q7TPD3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Robo2Q7TPD3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms