Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 32.6
DHX30Q7L2E3 F11-AS1-203ENST00000508287 669 ntTSL 36.63□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 32.6
DHX30Q7L2E3 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 225.39■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 332.88■■■□□ 2.852e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-205ENST00000446552 571 ntTSL 429.18■■■□□ 2.269e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-203ENST00000429585 769 ntTSL 529.18■■■□□ 2.269e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.122e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-206ENST00000449556 720 ntTSL 527.08■■□□□ 1.939e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-204ENST00000439372 604 ntTSL 426.72■■□□□ 1.879e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CYHR1-207ENST00000528558 907 ntTSL 225.92■■□□□ 1.749e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.684e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-202ENST00000422890 867 ntTSL 523.28■■□□□ 1.329e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 STARD7-202ENST00000443962 742 ntTSL 522.65■■□□□ 1.229e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.29e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 221.81■■□□□ 1.089e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.029e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 521.33■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.619e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.619e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-203ENST00000559353 587 ntTSL 318.53■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-205ENST00000560824 580 ntTSL 317.91■□□□□ 0.469e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.419e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.49e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-203ENST00000475775 693 ntTSL 217.52■□□□□ 0.49e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-205ENST00000602308 586 ntTSL 317.41■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-214ENST00000513250 567 ntTSL 317.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-206ENST00000602582 682 ntTSL 316.96■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 516.07■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-203ENST00000503151 627 ntTSL 315.89■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 215.69■□□□□ 0.19e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 515.29■□□□□ 0.049e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-210ENST00000508765 631 ntTSL 315.14■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 214.19□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 214.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.249e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.269e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 212.8□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 212.75□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TBCD-205ENST00000571618 775 ntTSL 312.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 GAK-210ENST00000507991 328 ntTSL 512.26□□□□□ -0.459e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 512.1□□□□□ -0.479e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.729e-8■■■■■ 32.5
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DHX30Q7L2E3 ALB-215ENST00000510166 532 ntTSL 310.52□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 32.4
DHX30Q7L2E3 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 321.97■■□□□ 1.113e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 317.76■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 315.73■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 518.8■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 219.41■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.953e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 47.93□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 231.54■■■□□ 2.641e-6■■■■■ 32.1
DHX30Q7L2E3 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 331.54■■■□□ 2.641e-6■■■■■ 32.1
DHX30Q7L2E3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 525.19■■□□□ 1.625e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 224.9■■□□□ 1.585e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 523.2■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.285e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 222.34■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 222.15■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 519.91■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 212.14□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 318.34■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 31.8
DHX30Q7L2E3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 31.8
DHX30Q7L2E3 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 31.8
DHX30Q7L2E3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-215ENST00000602164 582 ntTSL 331.43■■■□□ 2.623e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.843e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 31.5
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