Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF165Q6ZSG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF165Q6ZSG1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF165Q6ZSG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms