Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRC9Q6ZRR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRC9Q6ZRR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
LRRC9Q6ZRR7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRRC9Q6ZRR7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms