Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cand1Q6ZQ38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cand1Q6ZQ38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cand1Q6ZQ38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cand1Q6ZQ38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms