Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot1Q6ZQ08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot1Q6ZQ08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cnot1Q6ZQ08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms