Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC6Q6W4X9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MUC6Q6W4X9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC6Q6W4X9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms