Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD4L3Q6VB84 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD4L3Q6VB84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXD4L3Q6VB84 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXD4L3Q6VB84 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms