Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD1Q6SPF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD1Q6SPF0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAMD1Q6SPF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAMD1Q6SPF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms