Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gja6Q6S5G4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gja6Q6S5G4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja6Q6S5G4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja6Q6S5G4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms