Protein–RNA interactions for Protein: Q6R653

Unc5cl, UNC5C-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5clQ6R653 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Unc5clQ6R653 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Unc5clQ6R653 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Unc5clQ6R653 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Unc5clQ6R653 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Unc5clQ6R653 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms