Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CRIP3Q6Q6R5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRIP3Q6Q6R5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRIP3Q6Q6R5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms