Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R3

Crip3, Cysteine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip3Q6Q6R3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crip3Q6Q6R3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Crip3Q6Q6R3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Crip3Q6Q6R3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Crip3Q6Q6R3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Crip3Q6Q6R3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip3Q6Q6R3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms