Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC137Q6PK04 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC137Q6PK04 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC137Q6PK04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms