Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU9

Uncharacterized protein FLJ45252 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PIU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6PIU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PIU9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PIU9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6PIU9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PIU9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q6PIU9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q6PIU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6PIU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6PIU9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6PIU9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms