Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp1a3Q6PIC6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp1a3Q6PIC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a3Q6PIC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp1a3Q6PIC6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a3Q6PIC6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms