Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scaf4Q6PFF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scaf4Q6PFF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scaf4Q6PFF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms