Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Chd4Q6PDQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd4Q6PDQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
Chd4Q6PDQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd4Q6PDQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms