Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo42Q6PDJ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo42Q6PDJ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo42Q6PDJ6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms