Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3bQ6PDC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3bQ6PDC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc3bQ6PDC0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc3bQ6PDC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms