Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AAGABQ6PD74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AAGABQ6PD74 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AAGABQ6PD74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AAGABQ6PD74 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms