Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6PD19 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6PD19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6PD19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6PD19 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6PD19 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6PD19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6PD19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6PD19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6PD19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6PD19 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6PD19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6PD19 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6PD19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6PD19 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6PD19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6PD19 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6PD19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q6PD19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q6PD19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q6PD19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q6PD19 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6PD19 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6PD19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6PD19 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6PD19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6PD19 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6PD19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6PD19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6PD19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6PD19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6PD19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6PD19 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6PD19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6PD19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6PD19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6PD19 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q6PD19 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q6PD19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q6PD19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6PD19 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6PD19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6PD19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6PD19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6PD19 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms